انجمن علاوه بر سطوح مدیریتی (اعضای هیئت مدیره) و نظارتی (بازرس) از سطح اجرایی مشتمل بر چهار معاونت (نظارت حرفه ای - آموزش و درمان - پژوهشی - روابط عمومی و امور بین الملل) و چهار بخش (امور عضویت - امور مراکز درمان اعتیاد - امور حقوقی - تدارکات و پشتیبانی) تشکیل شده است.
معاونت نظارت حرفه ای
معاونت آموزش و درمان
معاونت پژوهشی
معاونت روابط عمومی و امور بین الملل
امور عضویت
امور مراکز درمان اعتیاد
امور حقوقی
تدارکات و پشتیبانی